 ดูบน TensorFlow.org |  ทำงานใน Google Colab |  ดูแหล่งที่มาบน GitHub |  ดาวน์โหลดโน๊ตบุ๊ค |
ภาพรวม
เครื่องประมาณค่าแบบกระป๋องเป็นวิธีที่ง่ายและรวดเร็วในการฝึกโมเดล TFL สำหรับกรณีการใช้งานทั่วไป คู่มือนี้สรุปขั้นตอนที่จำเป็นในการสร้างตัวประมาณค่า TFL แบบบรรจุกระป๋อง
ติดตั้ง
การติดตั้งแพ็คเกจ TF Lattice:
pip install tensorflow-lattice
การนำเข้าแพ็คเกจที่จำเป็น:
import tensorflow as tf
import copy
import logging
import numpy as np
import pandas as pd
import sys
import tensorflow_lattice as tfl
from tensorflow import feature_column as fc
logging.disable(sys.maxsize)
กำลังดาวน์โหลดชุดข้อมูล UCI Statlog (หัวใจ):
csv_file = tf.keras.utils.get_file(
'heart.csv', 'http://storage.googleapis.com/download.tensorflow.org/data/heart.csv')
df = pd.read_csv(csv_file)
target = df.pop('target')
train_size = int(len(df) * 0.8)
train_x = df[:train_size]
train_y = target[:train_size]
test_x = df[train_size:]
test_y = target[train_size:]
df.head()
การตั้งค่าเริ่มต้นที่ใช้สำหรับการฝึกอบรมในคู่มือนี้:
LEARNING_RATE = 0.01
BATCH_SIZE = 128
NUM_EPOCHS = 500
PREFITTING_NUM_EPOCHS = 10
คอลัมน์คุณลักษณะ
สำหรับประมาณการ TF อื่น ๆ ความต้องการข้อมูลที่จะส่งผ่านไปยังประมาณการซึ่งโดยปกติจะผ่าน input_fn และแยกวิเคราะห์โดยใช้ FeatureColumns
# Feature columns.
# - age
# - sex
# - cp chest pain type (4 values)
# - trestbps resting blood pressure
# - chol serum cholestoral in mg/dl
# - fbs fasting blood sugar > 120 mg/dl
# - restecg resting electrocardiographic results (values 0,1,2)
# - thalach maximum heart rate achieved
# - exang exercise induced angina
# - oldpeak ST depression induced by exercise relative to rest
# - slope the slope of the peak exercise ST segment
# - ca number of major vessels (0-3) colored by flourosopy
# - thal 3 = normal; 6 = fixed defect; 7 = reversable defect
feature_columns = [
fc.numeric_column('age', default_value=-1),
fc.categorical_column_with_vocabulary_list('sex', [0, 1]),
fc.numeric_column('cp'),
fc.numeric_column('trestbps', default_value=-1),
fc.numeric_column('chol'),
fc.categorical_column_with_vocabulary_list('fbs', [0, 1]),
fc.categorical_column_with_vocabulary_list('restecg', [0, 1, 2]),
fc.numeric_column('thalach'),
fc.categorical_column_with_vocabulary_list('exang', [0, 1]),
fc.numeric_column('oldpeak'),
fc.categorical_column_with_vocabulary_list('slope', [0, 1, 2]),
fc.numeric_column('ca'),
fc.categorical_column_with_vocabulary_list(
'thal', ['normal', 'fixed', 'reversible']),
]
เครื่องมือประมาณค่าแบบกระป๋อง TFL ใช้ประเภทของคอลัมน์คุณลักษณะเพื่อตัดสินใจว่าจะใช้ชั้นการสอบเทียบประเภทใด เราใช้ tfl.layers.PWLCalibration ชั้นสำหรับคอลัมน์คุณลักษณะที่เป็นตัวเลขและ tfl.layers.CategoricalCalibration ชั้นสำหรับคอลัมน์คุณลักษณะเด็ดขาด
โปรดทราบว่าคอลัมน์คุณลักษณะตามหมวดหมู่ไม่ได้ครอบคลุมคอลัมน์คุณลักษณะการฝัง พวกมันจะถูกป้อนเข้าสู่ตัวประมาณโดยตรง
กำลังสร้าง input_fn
สำหรับตัวประมาณอื่นๆ คุณสามารถใช้ input_fn เพื่อป้อนข้อมูลไปยังแบบจำลองสำหรับการฝึกอบรมและการประเมิน ตัวประมาณค่า TFL สามารถคำนวณปริมาณของคุณสมบัติได้โดยอัตโนมัติและใช้เป็นคีย์พอยท์อินพุตสำหรับเลเยอร์การสอบเทียบ PWL ที่จะทำเช่นนั้นพวกเขาต้องผ่าน feature_analysis_input_fn ซึ่งมีลักษณะคล้ายกับการฝึกอบรม input_fn แต่ด้วยยุคเดียวหรือ subsample ของข้อมูลที่
train_input_fn = tf.compat.v1.estimator.inputs.pandas_input_fn(
x=train_x,
y=train_y,
shuffle=False,
batch_size=BATCH_SIZE,
num_epochs=NUM_EPOCHS,
num_threads=1)
# feature_analysis_input_fn is used to collect statistics about the input.
feature_analysis_input_fn = tf.compat.v1.estimator.inputs.pandas_input_fn(
x=train_x,
y=train_y,
shuffle=False,
batch_size=BATCH_SIZE,
# Note that we only need one pass over the data.
num_epochs=1,
num_threads=1)
test_input_fn = tf.compat.v1.estimator.inputs.pandas_input_fn(
x=test_x,
y=test_y,
shuffle=False,
batch_size=BATCH_SIZE,
num_epochs=1,
num_threads=1)
# Serving input fn is used to create saved models.
serving_input_fn = (
tf.estimator.export.build_parsing_serving_input_receiver_fn(
feature_spec=fc.make_parse_example_spec(feature_columns)))
การกำหนดค่าคุณสมบัติ
การกำหนดค่าการสอบเทียบบาร์และต่อคุณลักษณะที่มีการตั้งค่าการใช้ tfl.configs.FeatureConfig การกำหนดค่าคุณลักษณะรวมถึงข้อ จำกัด monotonicity, กูต่อคุณลักษณะ (ดู tfl.configs.RegularizerConfig ) และขนาดตาข่ายสำหรับรูปแบบตาข่าย
หากไม่มีการกำหนดค่าที่กำหนดไว้สำหรับคุณลักษณะการป้อนข้อมูลการตั้งค่าเริ่มต้นใน tfl.config.FeatureConfig ถูกนำมาใช้
# Feature configs are used to specify how each feature is calibrated and used.
feature_configs = [
tfl.configs.FeatureConfig(
name='age',
lattice_size=3,
# By default, input keypoints of pwl are quantiles of the feature.
pwl_calibration_num_keypoints=5,
monotonicity='increasing',
pwl_calibration_clip_max=100,
# Per feature regularization.
regularizer_configs=[
tfl.configs.RegularizerConfig(name='calib_wrinkle', l2=0.1),
],
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='cp',
pwl_calibration_num_keypoints=4,
# Keypoints can be uniformly spaced.
pwl_calibration_input_keypoints='uniform',
monotonicity='increasing',
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='chol',
# Explicit input keypoint initialization.
pwl_calibration_input_keypoints=[126.0, 210.0, 247.0, 286.0, 564.0],
monotonicity='increasing',
# Calibration can be forced to span the full output range by clamping.
pwl_calibration_clamp_min=True,
pwl_calibration_clamp_max=True,
# Per feature regularization.
regularizer_configs=[
tfl.configs.RegularizerConfig(name='calib_hessian', l2=1e-4),
],
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='fbs',
# Partial monotonicity: output(0) <= output(1)
monotonicity=[(0, 1)],
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='trestbps',
pwl_calibration_num_keypoints=5,
monotonicity='decreasing',
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='thalach',
pwl_calibration_num_keypoints=5,
monotonicity='decreasing',
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='restecg',
# Partial monotonicity: output(0) <= output(1), output(0) <= output(2)
monotonicity=[(0, 1), (0, 2)],
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='exang',
# Partial monotonicity: output(0) <= output(1)
monotonicity=[(0, 1)],
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='oldpeak',
pwl_calibration_num_keypoints=5,
monotonicity='increasing',
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='slope',
# Partial monotonicity: output(0) <= output(1), output(1) <= output(2)
monotonicity=[(0, 1), (1, 2)],
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='ca',
pwl_calibration_num_keypoints=4,
monotonicity='increasing',
),
tfl.configs.FeatureConfig(
name='thal',
# Partial monotonicity:
# output(normal) <= output(fixed)
# output(normal) <= output(reversible)
monotonicity=[('normal', 'fixed'), ('normal', 'reversible')],
),
]
แบบจำลองเชิงเส้นที่สอบเทียบ
เพื่อสร้าง TFL กระป๋องประมาณการสร้างการตั้งค่ารูปแบบจาก tfl.configs ปรับเทียบแบบจำลองเชิงเส้นจะถูกสร้างขึ้นโดยใช้ tfl.configs.CalibratedLinearConfig ใช้การสอบเทียบทีละชิ้นและตามหมวดหมู่กับคุณสมบัติอินพุต ตามด้วยการผสมผสานเชิงเส้นและการสอบเทียบเอาต์พุตแบบแยกชิ้น-เชิงเส้นที่เป็นตัวเลือก เมื่อใช้การปรับเทียบเอาต์พุตหรือเมื่อกำหนดขอบเขตเอาต์พุต เลเยอร์เชิงเส้นจะใช้การถัวเฉลี่ยถ่วงน้ำหนักกับอินพุตที่ปรับเทียบแล้ว
ตัวอย่างนี้สร้างแบบจำลองเชิงเส้นตรงที่ปรับเทียบแล้วใน 5 คุณลักษณะแรก เราใช้ tfl.visualization พล็อตกราฟรุ่นที่มีแผนการสอบเทียบ
# Model config defines the model structure for the estimator.
model_config = tfl.configs.CalibratedLinearConfig(
feature_configs=feature_configs,
use_bias=True,
output_calibration=True,
regularizer_configs=[
# Regularizer for the output calibrator.
tfl.configs.RegularizerConfig(name='output_calib_hessian', l2=1e-4),
])
# A CannedClassifier is constructed from the given model config.
estimator = tfl.estimators.CannedClassifier(
feature_columns=feature_columns[:5],
model_config=model_config,
feature_analysis_input_fn=feature_analysis_input_fn,
optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(LEARNING_RATE),
config=tf.estimator.RunConfig(tf_random_seed=42))
estimator.train(input_fn=train_input_fn)
results = estimator.evaluate(input_fn=test_input_fn)
print('Calibrated linear test AUC: {}'.format(results['auc']))
saved_model_path = estimator.export_saved_model(estimator.model_dir,
serving_input_fn)
model_graph = tfl.estimators.get_model_graph(saved_model_path)
tfl.visualization.draw_model_graph(model_graph)
2021-09-30 20:54:06.660239: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:271] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected Calibrated linear test AUC: 0.834586501121521
แบบจำลอง Lattice ที่ปรับเทียบแล้ว
สอบเทียบรุ่นตาข่ายถูกสร้างโดยใช้ tfl.configs.CalibratedLatticeConfig โมเดลแลตทิซที่ปรับเทียบแล้วจะใช้การสอบเทียบแบบทีละชิ้นและแบบตามหมวดหมู่กับคุณสมบัติอินพุต ตามด้วยแบบจำลองแลตทิซและการสอบเทียบเอาต์พุตแบบทีละชิ้นซึ่งเป็นตัวเลือกเสริม
ตัวอย่างนี้สร้างแบบจำลองแลตทิซที่ปรับเทียบแล้วใน 5 คุณสมบัติแรก
# This is calibrated lattice model: Inputs are calibrated, then combined
# non-linearly using a lattice layer.
model_config = tfl.configs.CalibratedLatticeConfig(
feature_configs=feature_configs,
regularizer_configs=[
# Torsion regularizer applied to the lattice to make it more linear.
tfl.configs.RegularizerConfig(name='torsion', l2=1e-4),
# Globally defined calibration regularizer is applied to all features.
tfl.configs.RegularizerConfig(name='calib_hessian', l2=1e-4),
])
# A CannedClassifier is constructed from the given model config.
estimator = tfl.estimators.CannedClassifier(
feature_columns=feature_columns[:5],
model_config=model_config,
feature_analysis_input_fn=feature_analysis_input_fn,
optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(LEARNING_RATE),
config=tf.estimator.RunConfig(tf_random_seed=42))
estimator.train(input_fn=train_input_fn)
results = estimator.evaluate(input_fn=test_input_fn)
print('Calibrated lattice test AUC: {}'.format(results['auc']))
saved_model_path = estimator.export_saved_model(estimator.model_dir,
serving_input_fn)
model_graph = tfl.estimators.get_model_graph(saved_model_path)
tfl.visualization.draw_model_graph(model_graph)
Calibrated lattice test AUC: 0.8427318930625916
สอบเทียบ Lattice Ensemble
เมื่อฟีเจอร์มีจำนวนมาก คุณสามารถใช้โมเดลทั้งมวล ซึ่งสร้างแลตทิซขนาดเล็กกว่าหลายอันสำหรับชุดย่อยของฟีเจอร์และหาค่าเฉลี่ยของเอาต์พุต แทนที่จะสร้างเพียงแลตทิซขนาดใหญ่เพียงอันเดียว รุ่นตาข่ายทั้งมวลจะถูกสร้างขึ้นโดยใช้ tfl.configs.CalibratedLatticeEnsembleConfig รุ่นชุดขัดแตะขัดแตะที่ปรับเทียบแล้วจะใช้การปรับเทียบทีละชิ้นและตามหมวดหมู่กับคุณสมบัติอินพุต ตามด้วยชุดของรุ่นขัดแตะและการปรับเทียบเอาต์พุตแบบแยกชิ้น-เส้นตรงที่เป็นอุปกรณ์เสริม
สุ่ม Lattice Ensemble
การกำหนดค่าโมเดลต่อไปนี้ใช้ชุดย่อยของคุณลักษณะแบบสุ่มสำหรับแต่ละโครงข่าย
# This is random lattice ensemble model with separate calibration:
# model output is the average output of separately calibrated lattices.
model_config = tfl.configs.CalibratedLatticeEnsembleConfig(
feature_configs=feature_configs,
num_lattices=5,
lattice_rank=3)
# A CannedClassifier is constructed from the given model config.
estimator = tfl.estimators.CannedClassifier(
feature_columns=feature_columns,
model_config=model_config,
feature_analysis_input_fn=feature_analysis_input_fn,
optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(LEARNING_RATE),
config=tf.estimator.RunConfig(tf_random_seed=42))
estimator.train(input_fn=train_input_fn)
results = estimator.evaluate(input_fn=test_input_fn)
print('Random ensemble test AUC: {}'.format(results['auc']))
saved_model_path = estimator.export_saved_model(estimator.model_dir,
serving_input_fn)
model_graph = tfl.estimators.get_model_graph(saved_model_path)
tfl.visualization.draw_model_graph(model_graph, calibrator_dpi=15)
Random ensemble test AUC: 0.9003759026527405
RTL Layer Random Lattice Ensemble
กำหนดค่ารูปแบบต่อไปนี้ใช้ tfl.layers.RTL ชั้นที่ใช้เซตสุ่มของคุณสมบัติสำหรับแต่ละตาข่าย เราทราบว่า tfl.layers.RTL สนับสนุนเฉพาะข้อ จำกัด monotonicity และต้องมีขนาดตาข่ายเหมือนกันสำหรับคุณสมบัติและไม่มี regularization ต่อคุณลักษณะ หมายเหตุว่าการใช้ tfl.layers.RTL ชั้นช่วยให้คุณสามารถปรับขนาดเพื่อตระการตามีขนาดใหญ่กว่าที่ใช้แยกต่างหาก tfl.layers.Lattice กรณี
# Make sure our feature configs have the same lattice size, no per-feature
# regularization, and only monotonicity constraints.
rtl_layer_feature_configs = copy.deepcopy(feature_configs)
for feature_config in rtl_layer_feature_configs:
feature_config.lattice_size = 2
feature_config.unimodality = 'none'
feature_config.reflects_trust_in = None
feature_config.dominates = None
feature_config.regularizer_configs = None
# This is RTL layer ensemble model with separate calibration:
# model output is the average output of separately calibrated lattices.
model_config = tfl.configs.CalibratedLatticeEnsembleConfig(
lattices='rtl_layer',
feature_configs=rtl_layer_feature_configs,
num_lattices=5,
lattice_rank=3)
# A CannedClassifier is constructed from the given model config.
estimator = tfl.estimators.CannedClassifier(
feature_columns=feature_columns,
model_config=model_config,
feature_analysis_input_fn=feature_analysis_input_fn,
optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(LEARNING_RATE),
config=tf.estimator.RunConfig(tf_random_seed=42))
estimator.train(input_fn=train_input_fn)
results = estimator.evaluate(input_fn=test_input_fn)
print('Random ensemble test AUC: {}'.format(results['auc']))
saved_model_path = estimator.export_saved_model(estimator.model_dir,
serving_input_fn)
model_graph = tfl.estimators.get_model_graph(saved_model_path)
tfl.visualization.draw_model_graph(model_graph, calibrator_dpi=15)
Random ensemble test AUC: 0.8903509378433228
Crystals Lattice Ensemble
TFL ยังมีขั้นตอนวิธีการแก้ปัญหาคุณลักษณะการจัดเรียงที่เรียกว่า คริสตัล คริสตัล algorithm รถไฟแรกรุ่น prefitting ว่าจากจำนวนประมาณปฏิสัมพันธ์คุณลักษณะ จากนั้นจะจัดเรียงชุดสุดท้ายเพื่อให้คุณลักษณะที่มีการโต้ตอบที่ไม่เป็นเชิงเส้นมากกว่าอยู่ในโครงตาข่ายเดียวกัน
สำหรับรุ่นคริสตัลคุณยังจะต้องให้ prefitting_input_fn ที่ใช้ในการฝึกอบรมรุ่น prefitting ตามที่อธิบายไว้ข้างต้น แบบจำลองการปรับล่วงหน้าไม่จำเป็นต้องได้รับการฝึกฝนอย่างเต็มที่ ดังนั้นบางช่วงก็เพียงพอแล้ว
prefitting_input_fn = tf.compat.v1.estimator.inputs.pandas_input_fn(
x=train_x,
y=train_y,
shuffle=False,
batch_size=BATCH_SIZE,
num_epochs=PREFITTING_NUM_EPOCHS,
num_threads=1)
จากนั้นคุณสามารถสร้างรูปแบบคริสตัลโดยการตั้ง lattice='crystals' ในรูปแบบการตั้งค่า
# This is Crystals ensemble model with separate calibration: model output is
# the average output of separately calibrated lattices.
model_config = tfl.configs.CalibratedLatticeEnsembleConfig(
feature_configs=feature_configs,
lattices='crystals',
num_lattices=5,
lattice_rank=3)
# A CannedClassifier is constructed from the given model config.
estimator = tfl.estimators.CannedClassifier(
feature_columns=feature_columns,
model_config=model_config,
feature_analysis_input_fn=feature_analysis_input_fn,
# prefitting_input_fn is required to train the prefitting model.
prefitting_input_fn=prefitting_input_fn,
optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(LEARNING_RATE),
prefitting_optimizer=tf.keras.optimizers.Adam(LEARNING_RATE),
config=tf.estimator.RunConfig(tf_random_seed=42))
estimator.train(input_fn=train_input_fn)
results = estimator.evaluate(input_fn=test_input_fn)
print('Crystals ensemble test AUC: {}'.format(results['auc']))
saved_model_path = estimator.export_saved_model(estimator.model_dir,
serving_input_fn)
model_graph = tfl.estimators.get_model_graph(saved_model_path)
tfl.visualization.draw_model_graph(model_graph, calibrator_dpi=15)
Crystals ensemble test AUC: 0.8840851783752441
คุณสามารถพล็อตเทียบคุณลักษณะที่มีรายละเอียดเพิ่มขึ้นโดยใช้ tfl.visualization โมดูล
_ = tfl.visualization.plot_feature_calibrator(model_graph, "age")
_ = tfl.visualization.plot_feature_calibrator(model_graph, "restecg")
